基于全長轉(zhuǎn)錄組測序的多花黃精WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族分析
中國中藥雜志
頁數(shù): 12 2022-11-04
摘要: WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族在植物生長發(fā)育、次生代謝產(chǎn)物合成、生物和非生物脅迫響應(yīng)等過程發(fā)揮著重要的作用。該研究采用PacBio SMRT高通量測序技術(shù)對多花黃精進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組測序,利用生物信息學(xué)手段從多花黃精全長轉(zhuǎn)錄組中鑒定WRKY家族成員,分析其理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)進(jìn)化信息及保守基序。結(jié)果顯示,多花黃精全長轉(zhuǎn)錄組測序共獲得30.69 Gb數(shù)據(jù),去冗余后得到89 564條轉(zhuǎn)錄本...