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梔子全基因組SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性分析

中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志 頁(yè)數(shù): 6 2022-05-13
摘要: 目的 揭示梔子基因組的SSR分布規(guī)律,開(kāi)發(fā)SSR標(biāo)記引物,探究不同梔子居群間的遺傳差異。方法 利用MISA軟件對(duì)梔子全基因組序列進(jìn)行SSR位點(diǎn)搜索分析,Primer 3.0軟件設(shè)計(jì)SSR引物,然后對(duì)引物進(jìn)行有效性和多態(tài)性檢測(cè),并利用篩選到的多態(tài)性引物對(duì)6個(gè)居群的57份梔子材料開(kāi)展遺傳多樣性分析。結(jié)果 梔子基因組共鑒定到232 880個(gè)SSR位點(diǎn),每2.3 kb有1個(gè)SSR位點(diǎn),...

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