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通過圖注意力網(wǎng)絡(luò)識別空間轉(zhuǎn)錄組中的空間域

生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志 頁數(shù): 7 2024-04-11
摘要: 由于數(shù)據(jù)的高維和復(fù)雜性,空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析一直是一個具有挑戰(zhàn)性的問題,而聚類分析則是空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的核心問題。本文提出了一種基于圖注意力網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)方法,用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的聚類分析。首先,對空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行增強,然后使用圖注意力網(wǎng)絡(luò)對節(jié)點進(jìn)行特征提取,最后使用萊頓(Leiden)算法進(jìn)行聚類分析。通過聚類的評價指標(biāo)發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)的非空間及空間聚類方法相比,本文提出的方... (共7頁)

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