基于高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的斑重唇魚(yú)SSR分布及序列特征分析
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù): 9 2023-03-25
摘要: 【目的】基于高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析斑重唇魚(yú)SSR分布及序列特征,為斑重唇魚(yú)SSR分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)、遺傳多樣性、遺傳連鎖圖譜、種質(zhì)資源鑒定和分子輔助育種提供理論數(shù)據(jù)。【方法】使用Illumina NovaSeq高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)斑重唇魚(yú)皮膚組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,利用Trinity對(duì)獲得的高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝,再用MISA對(duì)篩選得到的1 kb以上的Unigenes進(jìn)行SSR分布及序列特...