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海南島淡水魚類eDNA宏條形碼COⅠ通用引物的篩選

漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展 頁數(shù): 18 2023-05-08
摘要: 已知的魚類環(huán)境DNA (environmental DNA, eDNA)宏條形碼通用引物主要位于線粒體核糖體基因區(qū),這些12S和16S引物存在部分近緣?mèng)~類無法識(shí)別及參考序列不足等問題。本研究以海南島淡水魚類為調(diào)查對(duì)象,基于8目26科101屬150種魚類COⅠ序列,篩選出6個(gè)側(cè)翼保守區(qū);綜合堿基變異、物種鑒定、e DNA降解及高通量測(cè)序讀長(zhǎng)需求,在4個(gè)側(cè)翼保守區(qū)設(shè)計(jì)了26條引物,...

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