融合卷積與自注意力機(jī)制的基因型填補(bǔ)算法

摘要： 基因型填補(bǔ)可以通過填補(bǔ)估算出在基因測序數(shù)據(jù)中未覆蓋的樣本區(qū)域彌補(bǔ)因技術(shù)限制導(dǎo)致的缺失，但現(xiàn)有的基于深度學(xué)習(xí)的填補(bǔ)方法不能有效捕捉到全序列位點(diǎn)間的連鎖關(guān)系，造成整體填補(bǔ)準(zhǔn)確率低、批量序列填補(bǔ)準(zhǔn)確率分散等問題。針對這些問題提出一種融合卷積與自注意力機(jī)制的填補(bǔ)方法——FCSA，使用兩種融合模塊構(gòu)成編解碼器組建網(wǎng)絡(luò)模型。編碼器融合模塊使用自注意力層得到全序列位點(diǎn)間的關(guān)聯(lián)度，將該關(guān)聯(lián)度融...